Роберта Лэнгдона, известного профессора в области символики, пригласили в Лувр. Там убили куратора музея Жак Соньер. Перед смертью куратору удалось оставить зашифрованное послание, использовав последовательность Фибоначчи. Капитан полиции Безу Фаш, с целью расшифровать послание, приглашает Роберта Лэнгдона на место преступления. Софи Невё, внучка убитого и криптолог, также пригласили для помощи в расшифровке таинственного послания. Она сообщает Лэнгдону, что его подозревают в убийстве куратора. Так как его имя указали в последней записи куратора. Софи уверена в том, что Лэнгдон сможет помочь раскрыть тайну своего дедушки. Она помогает Лэнгдону сбежать от полиции.
Подвергая свою жизнь смертельной опасности, Лэнгдон и Софи обнаруживают серию головоломок. Они скрыты в работах Леонардо да Винчи. Также они указывают на существование секретного общества — Приората Сиона. Это общество охраняет древнюю тайну, известную как «Источник Божьей власти на земле». Следуя подсказкам, спрятанным в картинах Леонардо да Винчи, они извлекают из парижского банка криптекс — деревянный контейнер с манускриптом. Они, однако, не могут открыть его, так как для этого нужно разгадать пятизначный код. В этой ситуации взломать криптекс невозможно, поскольку уксус, находящийся в капсуле криптекса, уничтожит документ.
А потом они идут к знакомому Лэнгдона, Ли Тибингу, который увлекается поисками Святого Грааля. Ли Тибинг считает Марию Магдалину женой Иисуса и рассказывает, что для ее защиты было создано тайное общество, членом которого был и дед Софи. Во время их разговора на них нападает религиозный фанатик по имени Сайлас. Он убил Жака Соньера, и пытается отобрать криптекс. Однако у него не получается, и герои вместе с профессором отправляются в Лондон, чтобы найти новую подсказку в Вестминстерском аббатстве.
Кстати, в Лондоне они узнают, что Ли Тибинг участвовал в убийстве Соньера. Он угрожает убить Софи и требует, чтобы Лэнгдон отдал ему криптекс и расшифровал код. Но в этот момент появляется полиция, которая арестовывает Тибинга, а Лэнгдон и Софи отправляются в Рослинскую церковь, где встречаются с членами древнего ордена. Они рассказывают Софи, что она — потомок рода Христа и Марии Магдалины.
По возвращении в Париж Лэнгдон осознает, что конечная цель их поисков — могила Марии Магдалины, и они все это время искали ее не в том месте, в то время как она находилась прямо под стеклянной перевернутой пирамидой Лувра.
