Ситуация с Лисбет Саландер и ее отцом Александром Залаченко складывается не лучшим образом. Они оба находятся в больнице в тяжелом состоянии. Лисбет должна предстать перед судом по обвинению в попытке убийства отца. Ее лечащий врач не разрешает ей общаться с кем-либо, кроме адвоката, в роли которого выбрана сестра Микаэля Блумквиста Анника. В то же время группа сотрудников службы безопасности, в которой работал Залаченко, не хочет разглашения конфиденциальной информации и принимает решение убрать обоих свидетелей. Один из участников группы, находясь в клинике, убивает Залаченко, но добраться до Лисбет ему не удается.
Между тем, журналистское расследование Микаэля Блумквиста, направленное на то, чтобы доказать невиновность Лисбет, набирает обороты. Ближе к моменту начала судебного разбирательства по делу Лисбет, Микаэль планирует выпустить специальный выпуск журнала «Миллениум», посвященный тайному сообществу. Его вызывают следователи, занимающиеся расследованием деятельности группы (рабочее название группы «Секция»), и они планируют арест её участников. Следователям удается организовать слежку, в результате которой становится понятно, что доктор Телебориан, наблюдавший за Лисбет в психиатрической лечебнице, где она провела детство, и в этот раз должен дать ложное заключение о ее невменяемости на процессе.
Микаэль через лечащего врача Лисбет передает ей смартфон, с помощью которого она связывается с хакером Чумой, а также пишет автобиографию, в которой подробно описывает свои впечатления от пережитого. Её автобиография попадает в руки Микаэлю, после чего она переводится из больницы на принудительное лечение до суда. Эрике, которая работает в журнале Микаэля, поступают угрозы по электронной почте, а затем кто-то швыряет в окно камни. Микаэль чудом избегает покушение на убийство, организованного Секцией. В связи с этим Эрика предлагает Микаэлю отложить выпуск журнала.
Начинается суд, в процессе которого доктор Телебориан дает показания, он подтверждает, что Лисбет является невменяемой. Он утверждает, что она представляет опасность. Несмотря на это, благодаря имеющимся у адвоката Лисбет видеозаписям, Телебориана обвиняют в нарушении правил конфиденциальности, а также в использовании архива детской порнографии, который был обнаружен хакером Чумой. Лисбет освобождают, а членов Секции арестовывают. Издательство «Миллениум» публикует выпуск, который подготовлен втайне от остальных.
В наследство от Залаченко Лисбет получает заброшенный кирпичный завод, а также его территорию. После того, как она приезжает, чтобы увидеть его, она обнаруживает там своего брата Нидермана, который уже давно скрывается там и уже убил нескольких человек. Благодаря пневматическому молотку, Лисбет смогла пригвоздить брата к полу и затем сообщить его врагам, что они могут найти его на заводе. Затем становится известно, что Нидермана убивают.
