Писатель Морт Рейни переживает тяжелый период. Его брак рушится из-за измены жены Эми с Тедом Мильнером. В попытке уйти от проблем, он уединяется в своем отдаленном доме у озера в штате Нью-Йорк. Его дни наполнены апатией, творческим застоем и вялым ожиданием развода.
Однажды к нему на порог является странный человек в шляпе, называющий себя Джоном Шуттером. Он обвиняет Морта в плагиате, утверждая, что тот украл у него рассказ под названием «Урожай». Шуттер требует справедливости и угрожает последствиями, если Морт не признает свою вину.
Морт сначала воспринимает Шуттера как сумасшедшего, но настойчивость и угрозы незнакомца постепенно начинают его пугать. Он пытается доказать свою невиновность, предоставив рукопись своего рассказа «Тайное окно, тайный сад», который был опубликован раньше, чем, по словам Шуттера, был написан его «Урожай». Однако Шуттер требует доказательств, подтверждающих дату написания.
По мере того, как время идет, ситуация накаляется. Шуттер начинает совершать акты вандализма и насилия, убивая собаку Морта и поджигая дом его друга. Морт обращается за помощью к местному шерифу, но тот относится к нему скептически, считая, что он сам виновен в происходящем.
В отчаянии Морт нанимает частного детектива Кена Карша, чтобы тот помог ему разобраться в происходящем и защитить его от Шуттера. Карш начинает расследование и вскоре находит улики, подтверждающие версию Морта. Однако он внезапно исчезает, а затем Морт находит его тело в своей машине.
Изолированный и напуганный, Морт начинает терять связь с реальностью. Он все больше запутывается в своих мыслях и поступках. Параллельно с этим, он пытается найти оригинал рукописи своего рассказа, чтобы окончательно доказать свою невиновность.
В финале фильма Морт осознает страшную правду: Джон Шуттер – это его альтер эго, порожденное чувством вины и гневом из-за измены жены. Он сам совершал все те ужасные вещи, в которых обвинял Шуттера. «Тайное окно, тайный сад» — это метафора его раздвоения личности, а тайное окно символизирует его подсознание, в котором скрывается темная сторона его личности.
Морт впадает в полное безумие. Он убивает свою жену Эми и Теда Мильнера, заманив их в дом у озера. Фильм заканчивается тем, что Морт, окончательно слившись со своим альтер эго, сидит в доме, ожидая прибытия полиции, и дописывает рассказ «Урожай», тем самым завершая свой безумный план мести.
